Meet GenomAgent: A Team of AI Specialists for Smarter Genomics Q&A

Share
Meet GenomAgent: A Team of AI Specialists for Smarter Genomics Q&A

TL;DR: Finding reliable answers in genomics is hard. GenomAgent turns one big AI into a coordinating team of specialists—and beats the current leader by 12% on a key benchmark.

Genomic facts live across many databases. Standard chatbots struggle because they can’t flexibly query those sources. GeneGPT added API calls but depends on rigid interfaces.

We replicated GeneGPT and built GenomAgent, a multi-agent system where dedicated agents search, retrieve, and cross-check information for complex genomics questions. The framework chooses and sequences tools as needed, making it easier to adapt when data sources change.

Results: On nine tasks from the GeneTuring benchmark, GenomAgent outperformed GeneGPT by an average of 12%.

Why it matters: More accurate, adaptable answers for researchers—and a blueprint that extends beyond genomics to other data-heavy sciences.

Paper: https://arxiv.org/abs/2601.10581v1

Authors: Kimia Abedini, Farzad Shami, Gianmaria Silvello

Paper: https://arxiv.org/abs/2601.10581v1

Register: https://www.AiFeta.com

#Genomics #AI #LLM #MultiAgent #Bioinformatics #Research #NLP #OpenScience

Read more

Kielimallit tekevät vaatimuskysymyksiä eri tyyleillä – ja tyyli riippuu käyttötarkoituksesta

Kielimallit tekevät vaatimuskysymyksiä eri tyyleillä – ja tyyli riippuu käyttötarkoituksesta

Uusi vertailu näyttää, että tekoälyn tapa muotoilla järjestelmävaatimuksia luonnollisen kielen kysymyksiksi vaihtelee mallin ja aiheen mukaan. Siksi tärkeintä ei ole valita ”parasta” mallia, vaan tilanteeseen sopiva. Kuvitellaan tuttu kokous: pöydän ääressä yritetään päättää, mitä uuden tietojärjestelmän pitää pystyä tekemään. Syntyy lista kysymyksiä, joihin järjestelmän on osattava vastata. Esimerkiksi: ”Mitkä lääkkeet

By Kari Jaaskelainen
Julkaistu ajattelu voidaan jo purkaa tekoälyksi

Julkaistu ajattelu voidaan jo purkaa tekoälyksi

Kun tutkija jättää työpöytänsä, hänen äänensä ei välttämättä vaikene. Pelkistä julkaisuista voidaan jo rakentaa tekoäly, joka ohjaa väitöskirjaa, arvioi artikkeleita ja väittelee paneelissa – uskottavasti. Useimmat meistä ajattelevat tutkimusartikkeleita kirjastoiksi: hyllyriveiksi ajatuksia, joihin muut voivat palata. Uusi arXivissa julkaistu esityspaperi ehdottaa toisenlaista kuvaa. Julkaisut ovatkin rakennuspiirustuksia, joista voidaan koota tekijänsä ajattelutapa

By Kari Jaaskelainen
Konferenssien suunta ei ole pakko syntyä suljettujen ovien takana

Konferenssien suunta ei ole pakko syntyä suljettujen ovien takana

Moni tietää tunteen seminaarin päätteeksi: ohjelma oli kiinnostava, mutta kuka päätti, mistä puhuttiin ja mistä ei? Usein vastaus on pieni ohjelmakomitea, joka tekee valinnat ennakkoon. Yleisö kuuntelee, harva vaikuttaa. Eräässä tekoälyn yhteiskunnallisia vaikutuksia käsittelevässä kansainvälisessä konferenssissa kokeiltiin toisenlaista tapaa. Osallistujat eivät vain tulleet paikalle – he auttoivat muokkaamaan itse tilaisuuden suuntaa.

By Kari Jaaskelainen